“外星人”DNA诞生,但不会长成吃小孩的怪物!突破生命法则极限,8碱基存储生命信息数量翻倍
我们可以想象一下,仅凭64个密码子,20种氨基酸就能形成地球上那么多的生命;那么更多的密码子,更多的氨基酸也就意味着,未来生命的形式更加会有无限可能,比如出现一个金刚狼什么的。哈佛大学带头的科学团队报道了一种全新的DNA,它不是由4种碱基构成,而是8种。当然这种全新的DNA不是自然界产生的,而是由科学家合成出来的,其被称作hachimoji DNA(在日语中hachi代表8,moji代表符号)。这种8碱基的DNA可以正常支持生命体的活动,就像4碱基DNA一样。其结构也能按照预期进行碱基配对,并转录成RNA并指导蛋白质合成。
▲图片来源:australasianscience
高中生物告诉我们,组成DNA的ATGC四种碱基可以随机排列形成64种不同的包含3个碱基的组合,形成生命的遗传密码,每个密码编码一种相应的氨基酸。不过由于某些不同的密码子,编码着相同的氨基酸,例如CGC,CGA,CGG和CGT都代表精氨酸。所以事实上,地球上所有生命所需的蛋白质主要由20种氨基酸组成的,无论是细菌还是人类。
物理学家薛定谔在著名的生物学著作《生命是什么》中认为,非周期性晶体保证了DNA分子信息的储存能力和无误的信息破解能力,并且它保证了DNA序列上碱基出现变化时不会直接对整个DNA结构产生破坏性的影响。南加州大学的分子生物学家Myron F. Goodman在上世纪末就已经证明,氢键并不是必需的。而碱基的大小统一非常重要。这让科学家开始创造碱基类似物,并将其混入到双螺旋、体外核酸链以及活细胞中。
第二代6碱基DNA
在65年前,沃森和克里克发现DNA双螺旋后就随后证实,它们按照A-T,G-C的两种方式进行组合。2012年,美国斯克利普斯研究所的合成生物学家Floyd E. Romesberg就创造出了第三对DNA碱基组合,它称其为5SICS-NaM。他检测了在这对新碱基加入后DNA的效率和保真性,发现能达到99.9%。。这也打开了DNA碱基合成生物学的大门,时隔2年,Romesberg就将这个6碱基系统导入了大肠杆菌中。意外地是,细菌对这种外来的新碱基并不排斥,相反它们还将其当做DNA组件,完成了双螺旋构建。为了简化碱基的名称,Romesberg将其定义为X-Y碱基,其表示,尽管只多了两个碱基,细胞可以合成的氨基酸数目就将从20种变成172种。
第三代8碱基DNA
在当年Romesberg的6碱基系统释出时,Steven A. Benner称赞其这是“巨大的成就”“更新了自然的规则”。6个碱基的系统,在利用氢键进行双链连接后,DNA同样可以完整地进行复制,并且能够完成生物学的基础PCR实验。这激起了Benner极大地兴趣,他提出一个问题,DNA双螺旋的分子极限在哪里?变成8个碱基后是不是还能维持薛定谔的非周期性晶体结构?
5年后,Benner与多个单位合作给出了答案。他开发出了8碱基系统,他将新增的碱基命名为Z-P和S-B碱基,它们与天然的碱基一样可以进行一一对应,并利用氢键结合。来自印第安纳大学医学院的研究团队展示了8碱基DNA的晶体结构,“新的DNA晶体结构完整,保持了正确的碱基配对,同时没有丢失天然DNA的关键性特征。”Millie Georgiadis表示。
▲G (绿色), A(红色), C (暗蓝色), T (黄色), B (青色), S (粉色), P (紫色), and Z (橙色)
来自得克萨斯州大学奥斯汀分校的Andrew Ellington制造了一种转录酶,成功地将hachimoji DNA转录成了RNA。在地球上,在演化的初期遗传信息都是以RNA形式储存,这一过程中生物也不断地修饰RNA组成的碱基,来让RNA完成一些催化功能。在有了4个碱基的组合后,地球生命选择了利用RNA合成蛋白质来完成大部分细胞功能,而转向更稳定的DNA进行遗传信息储存。
人造的外星生命?
Ellington回答了一个非常有意思的问题,那就是其他星球上是否能合成8碱基的DNA?他给我们构造了一个全新的世界,在这个世界中生命体有了4个碱基后并没有转向蛋白质,而是继续进行修饰更新,最后产生了更多的可用碱基。Ellington 说,“我认为8碱基DNA系统不可能凭空在细菌里自我组装出现,而是DNA-RNA-蛋白质这一中心过程共同完成合作进化而来,其他星球的生命是可能完成这项工作的。”
在去年,NASA就曾投入大量资金资助相关科学家找寻外星生命,在搜寻了木卫二、火星、土卫六都无果后,Benner就提出,外星生命更有可能出现在地球的实验室。“目前来说,hachimoji DNA还不能说是外星生命,”Benner解释道,“因为生命系统应该能完成自我延续。”而现在。“目前来说,hachimoji DNA还不能说是外星生命,”Benner解释道,“因为生命系统应该能完成自我延续。”而现在。
现在Benner也尝试利用它对一些其他分子进行追踪和绑定,可以明确地是,hachimoji DNA能够在培养皿中自动追寻和结合到肝癌细胞和乳腺癌细胞上。下一步,Benner正计划将其改造成“癌细胞猎手”,专门搜寻癌组织和病毒。
8碱基系统并不是Benner最终极的目标,他目前还在规划一对新组合K-X碱基,他想朝着10碱基系统迈进。碱基越多,就意味着密码子的组合更多,这也能为计算机信息储存提供新方向。DNA可以储存多少信息,hachimoji DNA就能储存2倍的信息量。Ellington认为这或许这能成为“密码基因组学”的开端。“更多的碱基组合意味着你能完成更大,更好,更稳定的数据库。”
新技术出现后总是无法避免公众的质疑,多碱基系统同样如此,总会有公众担心科学家是不是又创造了毁灭地球的怪物。Benner认为这是夸大其词,hachimoji DNA离开实验室后并不会有何作为,更不会吃掉你家养的小孩。但是其对生物医学贡献的潜力不容小觑,从目前的表现来看,hachimoji DNA很有可能成为监测疾病和病毒的新型药物,因此不但不会对你的小孩有威胁,反倒在将来可能成为保护他们的新工具。
作者:杨心舟
编辑:沈湫莎
责任编辑:姜澎
来源:环球科学、奇点网