2020年7月，根据上海轨道交通机场联络线的公示，本线路唯一的高架段发生方案变更，这一段在浦东新区的迎宾大道沿线。
上海轨道交通机场联络线的东段，也就是在浦东的高架段已经变更为地下，这一段全长是5.7公里，它也是地下段居多的机场联络线中的一个另类，变更之后已经没有了另类。
机场联络线（东段）的变更计划如下所示。
这里面要进行变更的是机场联络线东段的南六公路-川南奉公路之间的区段，这个区段原本是唯一高架段。
下面地图是上海轨道交通机场联络线的施工地图，可以看出其中一段高架的区段，已经在途中表示为蓝色。
根据上海轨道交通方面的消息，这个变更是在《上海市轨道交通机场联络线选线专项规划》（沪府规〔2018〕166号）、《上海市轨道交通机场联络线专项规划局部调整（黄浦江-凌空路段）》（沪府规划〔2019〕181号）两个既定方案的基础上进行的。
南六公路-川南奉公路之间的区段，位于浦东新区的迎宾大道的沿线，更改为地下之后，基本上一个地下与迎宾大道类似的地下通道。
下面照片就是浦东新区的迎宾大道。