为进一步方便乘客出行，12月26日起，5号线将启用新列车运行图，届时5号线将实现4、6编列车混跑，要至闵行开发区的乘客可直接在莘庄站乘坐4节编组列车直达，无需再进行换乘。
目前，5号线开行Y形交路。其中，莘庄站～奉贤新城站由6节编组列车载客；东川路站～闵行开发区站由4节编组列车载客。要至东川路站～闵行开发区站的乘客需在东川路站进行4、6编列车的换乘。
启用新图后：5号线将开行莘庄站～奉贤新城站及莘庄站～闵行开发区站两个交路。其中，莘庄站～奉贤新城站交路由6节编组列车载客运营，莘庄站～闵行开发区站交路由4节编组列车载客运营。届时，乘客可直接乘坐4节编组列车由莘庄站直达闵行开发区站，无需再进行4、6编列车换乘。
5号线莘庄站～东川路站双向运营间隔约2分30秒
启用新图后：工作日早高峰时段：5号线莘庄站～东川路站双向运营间隔约2分30秒，东川路站～奉贤新城站双向运行间隔平均3分45秒，东川路站～闵行开发区站双向运行间隔约7分30秒。
5号线优惠票价取消 恢复执行全网统一票价
此外，从2020年12月26日起，原为培育客流而实施的5号线既有段（莘庄站至闵行开发区站）内的优惠票价（2元起乘）将取消，5号线恢复执行全网络（除磁浮）统一票价，即0公里至6公里票价为3元，之后按每10公里增加1元递进。