沪苏通铁路开通运营初期，铁路部门将按照日常线、周末线、高峰线安排列车开行，每日开行旅客列车最高44.5对，开行货物列车6对。新增日常线、周末线开行列车为南通至上海虹桥9.5对，上海至南通4.5对，南京至上海虹桥1.5对，上海至南京5.5对，扬州至上海虹桥1对，上海虹桥至泰州1.5对，泰州至上海2对，黄山北至扬州（泰州）1对，南京至杭州南1对，启东至杭州南1对，启东到上海虹桥1对，上海至亳州南（阜阳西）1对，上海虹桥至（阜阳西）亳州南1对（具体开行日期以车站公告为准）。
沪苏通铁路开通运营后，将进一步提高铁路过江通道运输能力，完善长三角地区铁路网布局和区域综合交通运输体系。届时，苏州所辖张家港、常熟和太仓三市将同时接入长三角铁路网；南通至上海间的铁路出行径路也将实现“曲线变直线”，不需通过南京中转，预计两地之间铁路出行最短时间将从现在的3.5小时左右压缩到1小时6分钟。同时，上海虹桥至泰州、扬州最快运行时间分别为1小时48分钟、2小时22分钟，上海虹桥至太仓、常熟、张家港最快运行时间分别为32分钟、48分钟、53分钟。这条铁路的开通，将大大缩短上海与南通及苏北地区的时空距离，极大便利沿线群众出行，对增强上海中心城市辐射带动作用，推动长江三角洲区域一体化发展，具有重要意义。
沪苏通铁路是国家 “八纵八横”高铁网沿海通道，也是京沪第二通道的重要组成部分，北起江苏省南通市，从既有南京至启东铁路赵甸站引出，经南通市通州区，向南跨越长江，经江苏省苏州市的张家港、常熟、太仓市，终到上海市嘉定区，全长143公里，设计时速200公里。全线设赵甸、南通西、张家港北、张家港、常熟、太仓港、太仓、太仓南、安亭西9个车站。
铁路部门提醒广大旅客朋友，列车开行具体车次、时刻等相关资讯信息，请查询“中国铁路”微信和铁路12306网站、微信、客户端。