Science重点关注: 超过50%的顶级文章中的癌症研究结果不能重复-LMLPHP

对于肿瘤生物学的研究,后面的临床意义非常重大。不过,有时候虽然文章发表了,但是其文章的可重复性令人担忧。对于制药公司,需要重复这些结果时,就遇到了麻烦。在2013年10月开始,实施了雄心勃勃的癌症生物领域重复实验,计划重复50篇高影响力的癌症生物学论文,总资金达到130万美元,每项研究的费用约为25,000美元, 实验预计需要1年。但由于成本上涨及很难得到合适的材料,项目最终削减到18个,其中13个重复项目在eLife已经发表:6个大部分是可重复的,4个是不确定的,3个研究是否定的,超过一半的研究论文的结果不能被重现。由于在2018年7月31日,Science 总结了已经发表过的10个重复结果的结论,现在iNature总结了最近的3个重复结论,分别是:不能重复,不确定,能重复。

怎么规避不能重复实验,主要有以下方面:研究文章需要披露更多的实验细节,从原来研究团队得到原始材料,原始研究需花更多时间排除假阳性结果等方面。

Science重点关注: 超过50%的顶级文章中的癌症研究结果不能重复-LMLPHP

1.The microRNA miR-34a inhibits prostate cancer stem cells and metastasis by directly repressing CD44

重复文章的杂志:Nature Medicine

重复发表之后发表的杂志:Elife

重复结论:3个结论都不能

重复总结:完全不能重复

【1】结论1不能重复:与CD44-LAPC4细胞相比,从异种移植肿瘤(LAPC4细胞)中纯化的CD44 +前列腺癌细胞中microRNA miR-34a的表达水平是其两倍,而最初的研究报道miR-34a在CD44 + LAPC4细胞中表达是降低的(图1B; Liu等,2011);

【2】结论2不能重复:当将表达miR-34a的LAPC4细胞注射到小鼠体内时,研究人员没有观察到肿瘤生长或CD44表达的变化。然而,出乎意料的是miR-34a表达在体内丧失。在最初的研究中,与对照相比,表达miR-34a的LAPC4细胞具有统计学上显著的肿瘤再生减少和CD44表达降低(图4A和补充图4A,B和5C; Liu等,2011);

【3】结论3不能重复:测试miR-34a是否通过3'UTR中的结合位点调节CD44时,结果显示没有统计学上显著的差异,而最初的研究报道miR-34a降低CD44表达,其通过突变结合位点而部分消除。

参考链接:

https://www.nature.com/articles/nm.2284;

https://elifesciences.org/articles/43511

Science重点关注: 超过50%的顶级文章中的癌症研究结果不能重复-LMLPHP

2.Melanoma exosomes educate bone marrow progenitor cells toward a pro-metastatic phenotype through MET

重复文章的杂志:Nature Medicine

重复发表之后发表的杂志:Elife

重复结论:2个结论不能完全重复

总结:不确定

【1】结论1能重复:研究人员使用与原始研究相同的高转移性小鼠黑色素瘤细胞系(B16-F10),再生稳定表达短发夹的肿瘤细胞以降低Met表达(shMet),其有效地下调B16F10细胞中的Met,类似于原始研究【(补充图) 5A; Peinado等,2012)】。

【2】结论2能重复:研究人员测试了外泌体依赖性Met信号传导对原发性肿瘤生长和转移的影响,与原始研究中的结果相似,研究人员未发现原发肿瘤生长的统计学显著变化;

【3】结论3部分重复:测量肺和股骨转移,研究人员发现对照细胞的外泌体转移负荷略有增加,当Met表达减少时,外显子减少;然而,虽然效果与原始研究的方向相同(图4E; Peinado等,2012),但它们没有统计学意义。

参考链接:

https://www.nature.com/articles/nm.2753;

https://elifesciences.org/articles/39944;

Science重点关注: 超过50%的顶级文章中的癌症研究结果不能重复-LMLPHP

3.Intestinal inflammation targets cancer-inducing activity of the microbiota

重复文章的杂志:Science

重复发表之后发表的杂志:Elife

重复结论:3个结论都能重复

总结:结果能重复,但是程度不一样

【1】结论1能重复:当从大肠杆菌NC101中删除聚酮化合物合酶(pks)基因毒性岛时,研究人员观察到对细菌生长或定植能力没有影响,类似于原始研究(补充图7; Arthur等,2012)。

【2】结论2能重复:对于比较与NC101或NC101Δpks单相关的氧化偶氮甲烷(AOM)处理的白细胞介素-10缺陷小鼠的炎症,侵袭和瘤形成的实验,实验时间长于原始研究的实验时间。

【3】结论3能重复:在AOM治疗期间发生早期死亡,与NC101相比,在NC101Δpps单相关小鼠中观察到更高的死亡率,NC101处于相同方向,但比原始研究更严重(Suppleme1ntal图10; Arthur等人,2012)。与NC101Δppks单相关的小鼠死亡率高于NC101。

虽然这些数据无法解决在原始研究的条件下NC101和NC101Δpks在炎症,侵袭和瘤形成方面的差异,但这种复制尝试表明,实验方法的清晰描述对于确保实验研究的准确复制是必不可少的。

参考链接:

https://www.nature.com/articles/nm.2753;

https://elifesciences.org/articles/39944;

来源:转载自iNature|题图:图片库

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09-14 14:02